杨艳坤

职称：副教授

学历/学位：研究生/博士

电话：

电子邮箱：yangyankun@jiangnan.edu.cn

江苏省“六大人才高峰”入选者。从事发酵工程、微生物学、分子生物学、合成生物学的研究，主要承担分子生物学、生物化学、高级分子生物学课程的讲授工作。发表SCI研究论文60多篇，参编专著3部；申请发明专利20多项；主持国家重点研发计划、863、国家自然科学基金等国家级和省部级科研项目8项；主持企业横向项目7项；获得商业联合会全国科技进步2等奖1项；指导学生获得国家级和省级竞赛奖3项。

1997.09-2001.07，东北师范大学，生物技术专业，理学学士

2001.09-2006.07  中国科学院武汉病毒研究所，微生物学专业，理学博士

2006.07-2013.05  郑州大学，生物工程系，讲师

2013.05-今    江南大学，生物工程学院/粮食发酵与食品生物制造国家工程研究中心，副教授

2004.02-2005.06  英国卡迪夫大学，访问学者

2018.12-2019.12  美国伦斯勒理工学院，访问学者

一、论文（论著）发表情况

部分代表性论文如下：

1、 Li Ye, Mensah Emmanuel Osei, Fordjour Eric, Bai Jing, Yang Yankun, Bai Zhonghu. Recent advances in high-throughput metabolic engineering: Generation of oligonucleotide-mediated genetic libraries [J]. Biotechnol Adv, 2022, 59: 107970.

2、 Zhan Chunjun, Li Xiaowei, Yang Yankun, Nielsen Jens, Bai Zhonghu, Chen Yun. Strategies and challenges with the microbial conversion of methanol to high-value chemicals [J]. Biotechnol Bioeng, 2021, 118(10): 3655-3668.

3、 Wang Rongbin, Zhao Tianyu, Zhuo Junlin, Zhan Chunjun, Zhang Fuming, Linhardt Robert J, Bai Zhonghu, Yang Yankun. MAPK/HOG signaling pathway induced stress-responsive damage repair is a mechanism for Pichia pastoris to survive from hyperosmotic stress [J]. Journal of Chemical Technology & Biotechnology, 2021, 96(2): 412-422.

4、 Han Fei, Li Shijie, Yang Yankun, Bai Zhonghu. Interleukin-6 promotes ferroptosis in bronchial epithelial cells by inducing reactive oxygen species-dependent lipid peroxidation and disrupting iron homeostasis [J]. Bioengineered, 2021, 12(1): 5279-5288.

5、 Yang Yankun, Zheng Yating, Wang Pengcheng, Li Xiang, Zhan Chunjun, Linhardt Robert J., Zhang Fuming, Liu Xiuxia, Zhan Jinling, Bai Zhonghu. Characterization and application of a putative transcription factor (SUT2) in Pichia pastoris [J]. Mol Genet Genomics, 2020, 295(5): 1295-1304.

6、 Yang Yankun, Pan Yingyue, Liu Guoqiang, Dong Guibin, Zhan Chunjun, Koffas Mattheos A. G., Liu Xiuxia, Li Ye, Liu Chunli, Bai Zhonghu. Glycerol transporter 1 (Gt1) and zinc-regulated transporter 1 (Zrt1) function in different modes for zinc homeostasis in Komagataella phaffii (Pichia pastoris) [J]. Biotechnol Lett, 2020, 42(11): 2413-2423.

7、 Yang Yankun, Liu Guoqiang, Chen Xiao, Liu Meng, Zhan Chunjun, Liu Xiuxia, Bai Zhonghu. High efficiency CRISPR/Cas9 genome editing system with an eliminable episomal sgRNA plasmid in Pichia pastoris [J]. Enzyme Microb Technol, 2020, 138: 109556.

8、 Liu Xiuxia, Zhao Zihao, Dong Guibin, Li Ye, Peng Feng, Liu Chunli, Zhang Fuming, Linhardt Robert J., Yang Yankun, Bai Zhonghu. Identification, repair and characterization of a benzyl alcohol-inducible promoter for recombinant proteins overexpression in Corynebacterium glutamicum [J]. Enzyme Microb Technol, 2020, 141: 109651.

9、 Hou Chenglin, Yang Yankun, Xing Yan, Zhan Chunjun, Liu Guoqiang, Liu Xiuxia, Liu Chunli, Zhan Jinling, Xu Dinghua, Bai Zhonghu. Targeted editing of transcriptional activator MXR1 on the Pichia pastoris genome using CRISPR/Cas9 technology [J]. Yeast, 2020, 37(4): 305-312.

10、 Liu Chun-Li, Dong Hong-Gang, Zhan Jinling, Liu Xiuxia, Yang Yankun. Multi-modular engineering for renewable production of isoprene via mevalonate pathway in Escherichia coli [J]. J Appl Microbiol, 2019, 126(4): 1128-1139.

11、 Li Xinran, Yang Yankun, Wang Rongbin, Liu Guoqiang, Liu Xiuxia, Liu Chunli, Deng Yu, Bai Zhonghu. Quality by Design-Driven Process Development of Severe Fever With Thrombocytopenia Syndrome Vaccine [J]. J Pharm Sci, 2019, 108(12): 3785-3791.

12、 Li Xinran, Liu Xuerong, Wang Rongbin, An Fanglan, Nie Jianqi, Zhang Yunde, Ahamada Hadji, Liu Xiuxia, Liu Chunli, Deng Yu, Yang Yankun, Bai Zhonghu. Quality by Design-Driven Process Development of Cell Culture in Bioreactor for the Production of Foot-And-Mouth Veterinary Vaccine [J]. J Pharm Sci, 2019, 108(7): 2288-2295.

13、 Yang Yankun, Liu Guoqiang, Liu Meng, Bai Zhonghu, Liu Xiuxia, Dai Xiaofeng, Guo Wenwen. Correlation Between Protein Primary Structure and Soluble Expression Level of HSA dAb in Escherichia coli [J]. Food Technol Biotechnol, 2018, 56(1): 101-109.

14、 Li Xiang, Yang Yankun, Zhan Chunjun, Zhang Zhenyang, Liu Xiuxia, Liu Hebin, Bai Zhonghu. Transcriptional analysis of impacts of glycerol transporter 1 on methanol and glycerol metabolism in Pichia pastoris [J]. FEMS Yeast Res, 2018, 18(1): fox081.

15、 Zhan Chunjun, Yang Yankun, Zhang Zhenyang, Li Xiang, Liu Xiuxia, Bai Zhonghu. Transcription factor Mxr1 promotes the expression of Aox1 by repressing glycerol transporter 1 in Pichia pastoris [J]. FEMS Yeast Res, 2017, 17(4): fox015.

16、 Zhan Chunjun, Wang Songwei, Sun Yang, Dai Xiaofeng, Liu Xiuxia, Harvey Linda, McNeil Brian, Yang Yankun, Bai Zhonghu. The Pichia pastoris transmembrane protein GT1 is a glycerol transporter and relieves the repression of glycerol on AOX1 expression [J]. FEMS Yeast Res, 2016, 16(4): fow033.

17、 Liu Xiuxia, Hu Weiguo, An Zhanfei, Bai Zhonghu, Dai Xiaofeng, Yang Yankun. Exploration of cell lysis in a bioreactor using Escherichia coli expressing single-chain variable-domain antibody fragments [J]. Ann Microbiol, 2016, 66(3): 1207-1215.

18、 Chen Ana, Sun Yang, Zhang Wei, Peng Feng, Zhan Chunjun, Liu Meng, Yang Yankun, Bai Zhonghu. Downsizing a pullulanase to a small molecule with improved soluble expression and secretion efficiency in Escherichia coli [J]. Microb Cell Fact, 2016, 15(1): 1-10.

19、 Chen Ana, Li Yamei, Nie Jianqi, McNeil Brian, Jeffrey Laura, Yang Yankun, Bai Zhonghu. Protein engineering of Bacillus acidopullulyticus pullulanase for enhanced thermostability using in silico data driven rational design methods [J]. Enzyme Microb Technol, 2015, 78: 74-83.

20、 Chen Ana, Li Yamei, Liu Xiuxia, Long Quan, Yang Yankun, Bai Zhonghu. Soluble expression of pullulanase from Bacillus acidopullulyticus in Escherichia coli by tightly controlling basal expression [J]. J Ind Microbiol Biotechnol, 2014, 41(12): 1803-1810.

二、专利情况

1、 杨艳坤等. 表达外源蛋白的毕赤酵母、其构建方法及其诱导表达方法, CN201610623309.5.

2、 杨艳坤等. 抗人血清白蛋白单链抗体及其碳端连接多肽药物的方法, CN201210125323.4.

3、 杨艳坤等. 一种蛋白质, CN201510084726.2.

4、 杨艳坤等. 一种巴斯德毕赤酵母不同碳源下的内参基因及其引物和应用, CN114574617A

5、 杨艳坤等. 一种巴斯德毕赤酵母组成型启动子及其改造方法和应用, CN114574490A

三、承担教学科研项目情况

1、 国家重点研发计划子课题（课题号2021YFC2100203），所属专项：绿色生物制造；所属项目：工业酶通用高效表达系统构建；课题名称：工业酶酵母高效表达系统全局设计优化与创建；2021-07至2024-06，子课题负责人。

2、 国家自然科学基金委员会，面上项目，31570034，巴斯德毕赤酵母中甘油通过GT1和MXR1调控甲醇代谢的分子机理研究，2016-01至2019-12，主持。

3、 科技部，国家高技术研究发展计划(863计划)，2015AA020802，规模化动物细胞培养生产病毒疫苗成套装置系统的开发及相应生物过程工程研究，2015-01至2017-12，子课题负责人。

4、 教育部，中央高校基本科研业务费专项资金资助项目，JUSRP51401A，基于微反应器的HTP细胞筛选技术及ScFv谷氨酸棒杆菌表达纯化系统的建立，2014-01至2016-12，主持。

5、 国家自然科学基金委员会，青年基金，31001031，紫花苜蓿可调控的花发育抑制系统的构建及其在苜蓿种质创新中的应用，2010-01至2012-12，主持。

6、 主持江苏省产学研项目1项（项目号BY2015019-17），计划类别：政策引导类计划（产学研合作）--前瞻性联合研究项目；维生素B12、维生素D、叶酸免疫检测产品的研发，2015-07至2017-06，主持。

7、 江南大学研究生教育教学改革研究与实践课题，主持。

8、 优化课程教学体系建设服务于科研的高级分子生物学课程，主持。

9、 卓越课程建设项目：分子生物学，主持。

10、 研究生在线课程建设项目：高级分子生物学，主持。

四、获奖情况（含指导学生获奖）

1、 全国商业联合会科技进步奖二等奖，1/12。

2、 第三届全国大学生生命科学创新创业大赛国家一等奖，第1指导老师

3、 “创青春”全国大学生创业大赛国家铜奖，第1指导老师

4、 第四届中国“互联网+”大学生创新创业大赛省二等奖，第1指导老师

以上资料更新时间截止：2022年8月